(1)制备琼脂糖凝胶:检查凝胶模具是否完好,选择加样孔径大小适宜的梳板,垂直架在 模具的一端,使梳板底部离模具水平面的距离为1.0mm左右。按照被分离的DNA分子的大小决 定凝胶中琼脂糖的百分含量。
(2)称取一定量的琼脂糖,溶解在×1 TAE电泳缓冲液中,置微波炉中加热至琼脂糖溶化均匀(如果配制浓度为1%的琼脂糖凝胶:如体积为100ml,则需要称量琼脂糖粉末1g)。
(3)在凝胶中加入溴化乙啶(终浓度为0.5μg/ml), 轻摇混匀,待凝胶溶液冷却至50℃左右 时,轻轻倒入制胶模具中,凝胶厚度一般为0.3~0.5cm。若有气泡,及时去除。于室温下冷却凝固。
(4)凝胶冷却凝固30分钟后,将模具与凝胶一起放入电泳槽内。在电泳槽内加入×1 TAE 电泳缓冲液,至没过胶面,小心取出梳板,注意保持点样孔的完好。
(5)待测的DNA样品与1/5体积的上样缓冲液混匀后点样,进行琼脂糖凝胶电泳,记录样品 次序与上样量,在样品的一侧的点样孔中加入分子量标准。
(6)打开电源开关,选择适当的电压进行电泳,最高电压不高于5V/cm,当琼脂糖浓度低于 0.5%时,电泳时温度不能太高。电泳时间据实验具体要求而定,一般电泳30~60分钟即可。
(7)电泳至溴酚蓝指示剂接近凝胶尾端,停止电泳。
电泳结束后,取出凝胶直接在紫外透射仪上观察及分析结果,观察DNA 条带是否 清晰,有无拖尾,对照DNA ladder判断条带分子量大小。